В 2006 году на Чернобыльской АЭС произошла вторая катастрофа, в результате которой физические, химические и биологические процессы на данной территории изменились, появилось множество аномалий, артефактов и существ-мутантов.
Игра продолжает оригинальную трилогию. После событий «Зова Припяти» прошло несколько лет. За это время Зона Отчуждения сильно изменилась: она увеличилась в размерах, природа восстановилась, да и солнце теперь выглядывает намного чаще. Но вместе с тем появилось еще больше смертоносных аномалий и мутантов.
Более подробных деталей сюжета известно немного. Ученые все же смогли подключиться к информационному полю Земли, называемому ноосферой. Это запускает вереницу событий, в центре которых оказываются наемник по прозвищу Скиф и загадочное нечто под названием «Сердце Чернобыля». Артефакт ли это или название секретной лаборатории — неизвестно, но, вероятно, протагонисту предстоит найти его и решить судьбу всей Зоны, возможно, даже спасти ее.
Проходить прошлые части необязательно, поскольку сюжет данного проекта полностью самостоятелен. Но знание истории «Теней Чернобыля», «Чистого неба» и «Зова Припяти» все же добавит больше понимания происходящим событиям.
Обещают нелинейную историю и три концовки. Решения Скифа повлияют на судьбу ряда персонажей. Сделанные выборы закрывают доступ к определенным квестам, так что открыть весь контент с первого раза не получится.